Baktérie sú všade okolo nás, vo vzduchu, na objektoch a bežne sa nachádzajú v ľudskom tele a na ľudskom tele. Keď sú baktérie na ľudskom tele v neprítomnosti choroby, nazýva sa to kolonizátorom. Ľudia sa však môžu nakaziť patogénnymi baktériami z potravy, vody, odrenín a iných rán a dokonca aj z kolonizujúcich baktérií, ak sa dostanú do normálne sterilnej časti tela. Patogénne baktérie sú chorobou hostiteľa. Zoznam patogénnych baktérií je pomerne veľký, ale niektoré sú bežné príčiny chorôb u ľudí.
Staphylococcus
Skupina baktérií známa ako Staphylococcus, najmä Staphylococcus aureus, je jednou z najčastejších príčin ľudskej choroby. Väčšina stafylokokov kolonizuje pokožku a sliznice ľudí bez ochorenia. Avšak vzhľadom na správne stafylokoky môžu spôsobiť povrchové a systémové infekcie. Niektoré z bežnejších povrchových infekcií spôsobených S. aureus patrí vredy, impetigo a folikulitída. Závažnejšie a najčastejšie infekcie spôsobené týmto organizmom sú pneumónia, bakteriémia a infekcie kostí a rán. Staphylococcus aureus môže tiež produkovať toxíny, ktoré môžu spôsobiť rôzne choroby ako otravy jedlom a syndróm toxického šoku.
Iné druhy stafylokokov, ktoré bežne spôsobujú ochorenie u ľudí, sú Staphylococcus saprophyticus. Ide o bežnú príčinu infekcií močových ciest u sexuálne aktívnych žien.
Streptococcus
Rovnako ako stafylokoky, existuje veľa druhov streptokokov, ktoré sa normálne nachádzajú v ľudskom tele. Určité kmene streptokokov spôsobujú niektoré z najzávažnejších chorôb u ľudí. Streptococcus pyogenes (strep skupina A) je hlavnou príčinou bakteriálnej faryngitídy (strep krku) u ľudí. Neošetrené streptokoky môžu viesť k vážnym následkom, ako je reumatická horúčka (srdcové chlopne) a glomerulonefritída (obličky). Medzi ďalšie infekcie patrí impetigo a ničivé "baktérie vyživujúce mäso" inak známe ako nekrotizujúca fasciitída. Pri nekrotizujúcej fasciitíde dochádza k rýchlej deštrukcii mäkkých tkanív a svalov. Toto je často smrteľná choroba a je potrebné rýchle liečenie.
Gram-negatívne baktérie
Existujú desiatky rôznych druhov gramnegatívnych bacilov, pričom mnohé druhy sa zvyčajne nachádzajú v črevnom trakte. V črevnom trakte majú priaznivý účinok na telo tým, že zabraňujú prerábaniu potenciálnych patogénov. Avšak, ak sa operácia alebo trauma tieto baktérie dostanú z čreva, môžu spôsobiť vážne, život ohrozujúce ochorenie. Jednou z najbežnejších gramnegatívnych bacilov, ktoré spôsobujú ochorenie u ľudí, je Escherichia coli. Podľa Baileyho a Scottovej "Diagnostickej mikrobiológie" je E. coli zďaleka najbežnejšou príčinou nekomplikovaných infekcií močových ciest získaných v komunite a často sa vyskytuje pri infekciách rany. Niektoré kmene E. coli (ako je E. coli O157: H7) môžu spôsobiť vážne poškodenie hnačiek a obličiek.
Salmonella a Shigella sú dva gramnegatívne negatívne bacily známe ako príčiny otravy jedlom a dyzentérie.
Gram-negatívne bacily sa podieľali na infekciách tak rôznorodých, ako sú pneumónia až ušné infekcie.
Neisseria
Väčšina druhov Neisseria sa zvyčajne nachádza v ústach a ženských pohlavných orgánoch. Existujú však dva druhy, ktoré môžu spôsobiť veľmi vážne ochorenie u ľudí.
Neisseria gonorrhoeae je príčinou pohlavne prenosnej infekcie kvapavka. Toto je hlavná otázka verejného zdravia v Spojených štátoch a na celom svete. Neošetrené infekcie kvapavky môžu viesť k závažnejším ochoreniam, ako je gonokoková artritída a zápalové ochorenie panvy (PID).
Neisseria meningitída je príčinou meningokokovej meningitídy, vážnej, potenciálne život ohrozujúcej choroby miechovej tekutiny a meningí.